تعیین پاتوتیپ جدایه های اشریشیا کلی از گوساله و طیو ر در ایران با استفاده از روش ریزآرایه dna

زمینه مطالعه: ردیابی ژن های مربوط به عوامل حدت که در یک سویه از اشریشیا کلی حضور دارند جهت تعیین پروفایل ژنوتیپی و همچنین قرارگیری سویه در پاتوتیپی خاص از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. هدف: هدف از انجام این مطالعه تعیین پاتوتیپ جدایه های مختلف e. coli جدا شده از گوساله ها و طیور بومی ایران با استفاده از تکنیک ریزآرایه می باشد. روش کار: در مطالعه حاضر تعداد 67 جدایه از اشریشیا کلی پـس از جـداسـازی، با استفاده از روش نوین ریزآرایه dna (dna microarray) جهت تعیین پاتوتیپ هر جدایه مورد بررسی قرار گرفتند. در آرایه مورد استفاده پروب های ژنی مرتبط با 263 فاکتور حدت مختلف اشریشیا کلی قرار داشتند. نتایج: نتایج حاصل نشان دهنده این امر بود که از سویه های جدا شده از اسهال گوساله ها، 47 درصد به پاتوتیپehec، 68.15 درصد به پاتوتیپepec ، 68.15 درصد پاتوتیپ upec، 96.1 درصد به پاتوتیپetec ، 96.1 درصد ترکیبی از پاتوتیپ های epec وupec بوده و 17.64 درصد سویه ها غیر قابل اختصاص به پاتوتیپی خاص بودند و در مورد سویه های جدا شده از کلی باسیلوز طیـور 62.5 درصـد بـه پـاتـوتیپapec ، 25.31 درصد به پاتوتیپ expec و 6.25 درصد سویه ها غیر قابل اختصاص به پاتوتیپ خاصی بودند. نتیجه گیری نهایی: مطالعه حاضر نشان دهنده این امر می باشد که روش نوین ریزآرایهdna در مقایسه با روش های مولکولی مرسوم قادر است تعداد بالایی از ژن های حدت را در یک زمان و در مدت زمان کوتاهی بخوبی ردیابی کرده و در تعیین پروفایل ژنتیکی و تعیین پاتوتیپ ها مورد استفاده قرار گیرد.